生物与环境工程学院是为服务安徽省新兴产业建设和区域经济社会发展需求培养急需应用型人才而设立的专业学院。学院于2022年8月，由原化学与材料工程学院拆分组建而成。现设生物工程、生物制药、食品科学与工程三个本科专业，2010年开始招收本科生。食品科学与工程为校级重点学科。

学院拥有一支爱岗敬业、素质优良、学缘结构相对合理的教师队伍。专任教师中，高级职称教师占比25.8%，博士占比61.3%。教师先后荣获安徽省“教学名师”“教坛新秀”“优秀教学管理工作者”，安徽巢湖经开区“半汤好人（敬业奉献）”，校级“优秀教师”“我心目中的好老师”“优秀共产党员”“学术带头人”“中青年学术骨干”等各级各类荣誉。

学院现有“环巢湖乡村振兴协同技术服务中心（培育）”省级科研平台1个，校实验中心1个，教学实验室面积3000平方米，拟新建科研实验室1500平方米，拥有先进的显微互动实验室、啤酒与果酒酿造实训室、洁净度10万级生物制药实训室等校内实习实训室。仪器设备有荧光定量PCR、发酵罐、全自动酶标仪、PCR仪、高效液相、氨基酸分析仪等大型设备。实验室向所有学生开放，为本科生毕业论文、大学生创新创业训练、大学生竞赛、科研项目研究等提供实验条件。

学院坚持以高质量党建引领高质量发展。近3年主持各级教研、科研项目50余项，其中国家自然科学基金项目2项，安徽省科技重大专项1项，安徽省重点研究与开发项目2项，安徽省自然科学基金3项，省级质量工程项目近10项，发表高水平学术论文30余篇，授权国家发明专利6项。

学院落实立德树人根本任务，坚持“五育并举”，坚持“地方性、应用型”办学定位，坚持“立足合肥市、扎根环巢湖、服务安徽省、融入长三角”服务面向，秉承“德学并举  知行合一”校训和“润物泽境  惟实励新”院训，倡导“求真循理  勤谨精进”教风和“善思明辨  勉学尚能”学风，培养政治素质高、专业基础实、应用能力强，富有爱国情怀、社会责任感和创新创业精神的高素质应用型人才。

近3年，学生就业率均在93%以上，考研录取率在30%以上，150余名毕业生被中国科学院、中国科技大学、华南理工大学、南京大学、北京理工大学、南京工业大学、南京理工大学、合肥工业大学等名校录取为硕士研究生，多名毕业生在中科院、清华大学、江南大学等名校攻读博士学位。

近3年来，学生主持国家级大学生创新创业训练计划项目10余项；获省级以上各类学科竞赛获奖50余项；获“中国大学生自强之星（提名奖）”荣誉称号1人，获安徽省“优秀大学生”荣誉称号1人。

“十四五”时期，学院正围绕安徽省节能环保、绿色食品、生命健康等新兴产业建设和区域经济社会发展需求，聚焦“应用型学科培育”“环境类专业增设”“省级科研平台创建”“开展有组织科研”“生物技术与水科学交叉融合”“巢湖流域生态环境治理”“人才培养模式创新”等中心任务，推动创新链、产业链、人才链深度融合，提升教师服务地方能力，努力创建一流应用型综合性学院，为地方经济社会发展提供智力支持。